事務現業職員部は、事務職員と事務補助職員（会計年度任用職員）などからなり、労働条件の改善、職務の確立にとりくむとともに、教育条件の整備・拡充にもとりくんでいます。また全教事務職員部が企画・運営する全国学校事務研究集会の運営委員を長崎からも出しています。

2017年度の活動

• 7月　全国学校現業職員研究集会（宮城）
• 7月31日～8月1日　全国学校事務研究集会（東京）
• 11月　全教事務職員部中央行動（東京）
• 12月20日・1月19日　現業賃金確定交渉
• 1月27日　事務現業部総会（長崎市）

2016年度の活動

• 7月　全国学校現業職員研究集会（京都）
• 11月8日・21日　現業職賃金確定交渉
• 12月　中国・四国・九州ブロック学校現業職員学習交流集会（愛媛）
• 2月4日　事務現業部総会（長崎市）

2015年度の活動

• 5月　全教事務職員定期総会（東京）
• 7月　全国学校現業職員研究集会（群馬）
• 11月　全教事務職員部全国代表者会議（東京）
• 11月　現業職賃金確定交渉
• 12月5日～6日　中国・四国・九州ブロック学校現業職員学習交流集会（長崎市）
• 1月23日　事務現業部総会（長崎市）